مجتمع آزمایشگاهی دانشکده علوم دریایی در سال ۱۳۸۹ باهدف تأمین فضای مناسب و تجهیزات تخصصی لازم برای انجام پروژههای پژوهشی اعم از پایاننامههای دانشجوئی در مقاطع دکتری و کارشناسیارشد و کارشناسی و طرحهای تحقیقاتی که فضای مناسبی را برای آموزش دروس عملی رشتههای مختلف، علوم پایه در مقاطع مختلف تحصیلی را فراهم نموده است. این مرکز با تدابیر مدیریتی جدید آماده همکاری و جذب پروژههای ملی و تحقیقاتی و همچنین ارائه خدمات تخصصی آزمایشگاهی به مراکز علمی و صنعتی است.
با تأسیس رشتههای تحصیلی جدید در دانشگاه دریانوردی و علوم دریایی چابهار، آزمایشگاههای این مجتمع به شرح ذیل توسعهیافته است:
آزمایشگاههای تخصصی
آزمایشگاههای آموزشی
آزمایشگاههای آموزشی:
۱. آزمایشگاه زیستشناسی
۲. آزمایشگاه شیمی
۳. آزمایشگاه جانورشناسی، ماهیشناسی و ژنتیک
۴. آزمایشگاه پژوهشی ۱
۵. آزمایشگاه پژوهشی ۲